La iglesia dedicada a Sant'Apollinare se encuentra en el antiguo Pozzo di Villa, un distrito dentro de las murallas de la ciudad.
Las estructuras más antiguas de la iglesia de Sant'Apollinare datan de finales del siglo XIII. De estas, de formas góticas italianas, el único rastro es la forma del portal de la fachada, tapiado durante la posterior reconstrucción a mediados del siglo XVII. Las obras de ampliación, de hecho, se llevaron a cabo desde la primera década hasta los años cincuenta del siglo XVII e implicaron una caracterización de todo el edificio en un sentido renacentista tardío. La fachada se construyó en 1646, como lo atestigua la fecha grabada en el dintel del portal, mientras que la cubierta, casi terminada en 1651, cuando un incendio dañó parte de las estructuras, se completó en 1652, tras la gran peste.
La nueva fábrica incorporó parte de la anterior, ampliando el edificio de la izquierda, que casi duplicaba su ancho; el lado derecho y parte de la fachada de la primitiva iglesia se utilizaron como muros de carga; además, se adoptó una técnica de construcción diferente, en piedras soldadas con mortero de cal y arena, en comparación con las piedras y el barro arcilloso.
En 1896, tras el derrumbe de las paredes laterales y los daños en la bóveda, se decidió cerrar la iglesia y, en 1898, se iniciaron las obras de demolición de la bóveda y la consolidación de las estructuras, pero, tras el progresivo fracaso de las estructuras, se llevó a cabo una demolición casi completa y una reconstrucción en formas neogóticas. Solo se salvaron el campanario, la capilla del ábside y la fachada. Gracias a una descripción previa a estas reconstrucciones, es posible conocer la estructura de la iglesia del siglo XVII, basada en el patrón de las iglesias congregacionales de ascendencia contrarreformista, típico de las iglesias de Sassari del siglo XVII, con una sala de una sola nave convertida en barril, con tres capillas a cada lado, un ábside cuadrangular con bóveda de cañón y un campanario con un cañón inferior cuadrado y un superior octogonal cañón, con aberturas curvas y una cúpula alargada en segmentos, coronada por la cruz.
La fachada, cuya ornamentación geométrica está tomada de la iglesia de Jesús y María (hoy Santa Caterina, Sassari) y reinterpretada en un sentido plateresco, está enmarcada por dos almohadas angulares salientes con una base moldeada sobre un zócalo alto, y está dividida en dos órdenes por un marco moldeado decorado con un friso con óvolos y tiras. La primera, lisa, presenta un sencillo portal rectangular con dinteles en las estanterías. La superior está dividida en espejos por cuatro pilastras apoyadas sobre el marco marcapiano, de las cuales las centrales están decoradas con cofres. Entre ellas hay una gran ventana ciega a dos aguas, con un marco doble decorado con adornos clasicistas y flanqueada además por dos pilastras más estrechas e inferiores, decoradas como la mayor y rematadas por pináculos; sobre el tímpano hay una cruz tallada.
Un marco resaltado por dentelos y ovolos cierra el segundo orden y es la base del frontón de extremo plano, delimitado lateralmente por la continuación de las pilastras centrales en forma de caja. En el espejo, entre dos columnas retorcidas, hay dos ventanas ciegas curvadas una al lado de la otra, con un marco adornado con tallas y dentículos, sobre el cual se encuentra el marco de coronación, moldeado y adornado en la parte inferior por un friso clásico en forma de palmeta y en la parte superior por una secuencia de festones, ovejas y dentículos alternados.

Historia de los estudios
La iglesia es mencionada por Enrico Costa (1937). Tras el estudio de Marisa Porcu sobre la historia de la arquitectura de Sassari (1996), Aldo Sari la cita en el volumen dedicado a la archidiócesis de Turritana (2003).

Bibliografía
E. Costa, Sassari, Sassari, 1937;
A. Marcellino, El milagroso Santísimo Cristo de San Apolinar de Sassari, 1946;
C. maltés, Arte en Cerdeña del V al XVIII, Roma, 1962;
E. Costa, Archivo pictórico de la ciudad de Sassari (diplomático, heráldico, epigráfico, monumental, artístico, histórico), editado por E. Espa, Sassari, 1976; F. Segni Pulvirenti - A. Sari, Arquitectura gótica tardía y renacentista, serie «Historia del arte en Cerdeña», Nuoro, Ilisso, 1994, pág. 276;
M. Porcu Gaias, Sassari. Historia arquitectónica y urbana desde sus orígenes hasta el siglo XVII, Nuoro 1996;
A. Sari, La iglesia en la archidiócesis de Sassari, serie «Iglesias y arte sacro en Cerdeña», Sestu, Zonza, 2003.