El edificio religioso está ubicado en las afueras del distrito de Stampace, en una parte montañosa que se hizo plana cerca de las murallas de Castello.
La institución de la orden religiosa de monjas clarisas se remonta a 1212 y se remonta a la voluntad de Francisco de Asís. En un período cronológico comprendido entre finales del siglo XVI y el primer cuarto del siglo XIII, Cagliari acogió a las Clarisas de Stampace en el monasterio, hoy desaparecido, que recibió el título de Santa Clara, probablemente fundado anteriormente por monjas de diferentes reglas. El convento de clausura de los Pobres Clavers fue administrado por los frailes del cercano San Francisco de Stampace hasta 1587, cuando entró, a instancias del Papa Sixto V, bajo los auspicios de la cantina arzobispal. En 1895, tras la promulgación, en 1866, de la segunda ley que suprimía las órdenes religiosas, el monasterio pasó a ser administrado por el Fondo para el Culto, pero seguía en boga, a pesar de que solo albergaba a siete monjas, en comparación con las veintinueve certificadas por Martini en 1841; en 1897 pasó a formar parte del Estado Municipal. En cambio, fue abandonado durante el siglo XX: en 1911 pasó a ser propiedad de la Autoridad Financiera, para regresar al Municipio en 1922 y, finalmente, se vio gravemente comprometido por los bombardeos aéreos de 1943, seguidos de la demolición de la mayoría de las ruinas y, a partir de 1957, el establecimiento del mercado local. La excavación y restauración arqueológicas realizadas recientemente, entre 1980 y mediados de los noventa, por la Superintendencia Arqueológica y la Superintendencia de BAPPSAE de Cagliari y Oristano han especificado las hipótesis de datación relacionadas con el complejo: la iglesia es del siglo XVII, aunque construida sobre una sala románica anterior, mientras que la existencia del convento ha sido atestiguada indirectamente desde las últimas décadas del siglo XIII, en la época de la dominación pisana.. Por lo tanto, es probable que la zona albergara un complejo monástico más antiguo, en el que se insertó entonces el franciscano.
En lo que respecta a la iglesia de Santa Chiara, los documentos de archivo han confirmado la insistencia, muy probablemente en el mismo sitio, de una pequeña capilla preexistente: de hecho, el primer testimonio documental de la existencia de una iglesia dedicada a Santa Margherita se remonta a 1256, cuya fecha de fundación se desconoce. Incluso en 1861, Spano afirmó que el edificio actual se construyó en el siglo XVII con el título de Santa Margherita, según lo que pudo detectar en la inscripción S MARGARITA V M 1690, grabada en el dintel del portal lateral y aún visible. Sin embargo, algunos estudiosos han planteado recientemente la hipótesis de la existencia de dos iglesias separadas, aunque cercanas en el espacio: la iglesia de Santa Chiara que aún existe y, de hecho, la de Santa Margherita, demolida en 1947.
El edificio tiene una sola nave grande con capillas laterales y un presbiterio rectangular elevado, de altura y anchura reducidas en comparación con el aula; los interiores muestran una abundante decoración de estuco. La sobria fachada enlucida termina con una molestia «como la lámpara de un carabinero», es decir, un arco de doble flexión, en este caso rematado en volutas; también tiene dos aberturas cuadrangulares simétricas con respecto al portal central, coronadas por una pequeña hornacina con una pila decorada con una concha, que anteriormente albergaba una estatua. El pasillo se ha convertido en cuadrado, salpicado por socavones colocados sobre pilotes ranurados levantados por el capitel corintio, colocados en los contrafuertes externos; la bóveda insiste en un marco saliente con muescas sobre un friso decorado. El coro, donde las monjas participaban en las funciones litúrgicas, se basa en un arco rebajado y tiene una hornacina decorada con una concha, así como una balaustrada adornada con un escudo de armas. Paralelamente a la construcción de la iglesia, en 1690, se colocaron en su interior algunos entierros cubiertos con lápidas de mármol, dos de las cuales, que datan del tercer cuarto del siglo XVII, se trasladaron recientemente a una contrafachada; a principios del siglo XVIII, finalmente se construyó la sacristía junto al presbiterio, que alberga una tumba reservada para el entierro de las monjas.

Bibliografía
P. Martini, Historia eclesiástica de Cerdeña, III, Cagliari, Royal Stamperia, 1841;
G. Spano, Guía de la ciudad y los alrededores de Cagliari, Cagliari, Timón, 1861;
F. Corona, Guía de Cagliari y sus alrededores, Bérgamo, Instituto Italiano de Artes Gráficas, 1894;
R. Salinas, «La arquitectura del Renacimiento en Cerdeña: los primeros ejemplos», en Estudios sardos, XIV-XV, parte II, 1955-57; Santa Chiara.
Restauraciones y descubrimientos, editado por A. Ingegno, Cagliari, Pisano, 1993;
M.G. Meloni, «Notas sobre la presencia de las clarisas en Cerdeña en la Edad Media», en Boletín bibliográfico y revista archivística y estudios históricos de Cerdeña, XI, fasc. 18, 1994; M. Pintus, «Arquitectura», en los barrios históricos de Cagliari. Stampace, Cinisello Balsamo, Silvana, 1995;
M. Dadea - S. Mereu - M.A. Serra, archidiócesis de Cagliari, serie «Iglesias y arte sacro en Cerdeña», Cagliari, Zonza, 2000.