Quartu Sant'Elena es la tercera ciudad de Cerdeña, después de Cagliari y Sassari, y tiene todas las características de un centro urbano de tamaño mediano. La iglesia de Sant'Agata está a poca distancia de la iglesia parroquial de Sant'Elena.
La icnografía, la técnica de albañilería y los elementos desnudos insertados en la fábrica permiten fechar la planta entre 1140 y 1160. Estaba relacionada con una iglesia románica de una sola habitación, con un gran ábside semicircular orientado hacia la N/E, cuyos cimientos y una sección prominente se han encontrado y dejado expuestos.
El título se menciona por primera vez en una carta de 1291, enviada por el papa Nicolás IV al arzobispo de Cagliari Percivalle (1290-95), en la que se concedía indulgencia a los fieles que habían visitado la catedral de Cagliari y la iglesia de Santa Ágata en Quarto con motivo de la fiesta de Santa María y de su patrona respectiva.
Entre 1280 y 12300, los trabajadores locales reconstruyeron la iglesia sobre los mismos cimientos y reutilizando materiales. Siempre tuvo una sola nave, pero un ábside rectangular con bóveda de crucería, que deriva de San Francesco di Stampace en Cagliari, construido por trabajadores pisanos entre 1274 y 1285 según métodos de construcción góticos.
En 1365, junto con una vasta área circundante, formó parte del patrimonio episcopal, como se deduce del inventario de los ingresos eclesiásticos de Cagliari en relación con los bienes que no provenían de las órdenes monásticas. Por lo tanto, se puede suponer que era propiedad del obispo incluso en épocas anteriores.
En 1599, como lo demuestra la visita pastoral del arzobispo de Cagliari Lasso Sedeño, la iglesia se encontraba en un estado de grave deterioro y se ordenó su reparación.
En 1631, el obispo Ambrogio Machin donó la iglesia y sus electrodomésticos a los padres capuchinos, que llegaron a Cagliari en 1590, quienes la restauraron con importantes modificaciones para adaptarla a sus necesidades litúrgicas: reconstruyeron la fachada, sustituyeron el techo de madera de la nave por bóvedas de cañón y crucería y dividieron el espacio del aula para obtener un gran presbiterio y un coro detrás, incluido el antiguo ábside rectangular.
En 1702, se construyeron tres capillas entre los contrafuertes del lado derecho, siguiendo nuevamente el patrón característico de las iglesias capuchinas. En el lado izquierdo, se anexó el convento, de cuya estructura original se conservan algunas habitaciones, y el claustro con el gran tanque. El nuevo complejo religioso lleva el nombre de San Francisco. La obra duró mucho tiempo, principalmente gracias a los legados durante un período de más de diez años, a partir de 1633.
En 1866, todo el complejo fue confiscado para convertirlo en bienes del Estado y, en 1868, cedido al municipio de Quartu, que dejó la iglesia abierta al culto y oficiada por los propios capuchinos; desde 1886 está confiada al clero de la parroquia de Santa Elena. El convento, sometido a importantes modificaciones que alteraron su estructura original, se utilizó como escuela y en 1925 se le concedió al sacerdote cuarés Virgilio Angioni, fundador del Instituto del Buen Pastor, la construcción de un albergue para los pobres y un hospital. Luego se convirtió, hasta 1985, en una residencia de ancianos.
De 1902 a 1925, la iglesia fue destinada al uso civil y no fue devuelta al clero de Santa Elena hasta 1926. Durante este período, para que el espacio fuera funcional para nuevos usos, se rellenaron algunos nichos de los siglos XVI y XVIII y se abrieron ventanas rectangulares en la segunda y tercera capillas. Los trabajos de restauración han devuelto a la iglesia, que entretanto pasó a llamarse
Sant'Agata, su aspecto de «capuchino». El antiguo convento, restaurado entre 1993 y 2001 eliminando las superfetaciones y destacando las estructuras más antiguas, alberga una galería de arte, un museo y una biblioteca especializada.
En la bóveda de la sala de conferencias, se colocó la gran pintura mural, de 1899, separada de la bóveda del antiguo Ayuntamiento.

Historia de los estudios

Los trabajos de restauración, realizados entre 1990 y 1996, permitieron a Ida Farci releer las diferentes fases de construcción del monumento.

Bibliografía
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Arte religioso desde la Edad Media hasta el siglo XX, Cagliari, Stef, 1988;
R. Coroneo, Arquitectura románica desde mediados del siglo mil hasta principios del siglo XIII, Nuoro, Ilisso, 1993, página 163; I. Farci-A.
Ingegno, La iglesia de Sant'Agata en Quartu Sant'Elena. Relectura tras la restauración, Cagliari, Stef, 1994; R. Coroneo, iglesias románicas de Cerdeña. Itinerarios turístico-culturales, Cagliari, AV, 2005, p. 94;
I. Farci, «Iglesia de Sant'Agata y antiguo convento capuchino de San Francisco en Quartu Sant'Elena», en Las joyas de la arquitectura religiosa. Historia, restauraciones y mobiliario, desde el estilo románico hasta el clásico, comisariados por N. Rossi-S. Meloni, Dolianova, Grafica del Parteolla, 2005;
G. Montaldo, «Iglesia de Sant'Agata y antiguo convento capuchino de San Francisco: recuperación de la arquitectura del monumento», en Las joyas de la arquitectura religiosa. Historia, restauraciones y mobiliario, desde el estilo románico hasta el clásico, comisariados por N. Rossi-S. Meloni, Dolianova, gráfico de Parteolla, 2005.